Balyoz davasında 18 yıl hapis cezasına çarptırılıp Hasdal Askeri Cezaevine gönderilen Çakmak, cezaevinde rahatsızlanmıştı. Silivri Cezaevi'nden Yedikule Göğüs Hastalıkları Hastanesine sevk edilen Cem Aziz Çakmak hakkında hazırlanan raporda, akciğerinde kitle tespit edildiği ve tedavisini hastanede yatarak sürdürmesinin uygun olacağı belirtilmişti.
Adli Tıp Kurumu tarafından akciğer kanseri olduğu belirlenen Çakmak'ın cezasının infazının 1 Ağustos'a kadar ertelenmesi kararlaştırılmıştı.
İnfaz savcılığı Çakmak'ın cezasını 6 ay erteleyip tahliye etmiş ardından Balyoz davası sanıklarının yeniden yargılanmasının sonucunda Çakmak da beraat etmişti.
Uzun süredir Ankara GATA'da tedavi gören Çakmak, 21 Haziran'da yoğun bakıma alındı.
Çakmak, sabah saatlerinde hayatını kaybetti.